Comparing Graphical User Interfaces (GUI), Macros, and Coding

Author

Agustin Corbat

Published

August 4, 2026

TipObjetivos de Aprendizaje

Al finalizar la sesión, los alumnos serán capaces de:

  • Comprender las ventajas y desventajas entre interfaces gráficas (GUI), macros/scripts y programación directa para el análisis de bioimágenes.

  • Evaluar la accesibilidad, transparencia, escalabilidad y mantenimiento de las distintas herramientas.

  • Convertir un flujo de trabajo manual (GUI) en un flujo de trabajo documentado y reproducible.

Prerequisitos

Programas instalados

  • Fiji / ImageJ
  • Python y Jupyter Notebooks
  • Napari

Datos descargados

Imreh, G., Miranda, G., Imreh, G., Corbat, A. A., Le Guyader, S., Le Guyader, S., BioImage Informatics Unit& Karolinska Institutet. (2025). LCI Light Microscopy Course: Noise Level versus Averaging Dataset (Version 1.0) [Dataset]. Zenodo.

Conocimientos previos

  • Conceptos básicos de preprocesamiento y segmentación clásica de imágenes.

Citation

Corbat, A. A. (2026). Taller de Segmentación y Cuantificación de Imágenes (Version v0.1) [Computer software]. Zenodo. Taller de Fundamentos en Análisis de Bioimágenes (Formación de Formadores) 2026 (TFBIA(FdF)), Buenos Aires, Argentina. https://doi.org/10.5281/zenodo.21693542