Programa

🗓️ Día 1: Fundamentos del Análisis de Imágenes y Procesamiento Clásico (Lunes 3 de Agosto)

09:00–10:00 - 🤗 Bienvenida, expectativas de los participantes y presentación de objetivos.
- ¿Por qué un formato Train-the-Trainer en Latinoamérica? Ecosistema y sostenibilidad regional. (Agustin Corbat, Lorena Sigaut y Lia Pietrasanta)
10:15–11:00 - 🧠 Qué es el Análisis de Bioimágenes (Federico Lecumberry)
- Visión general del análisis de bioimágenes
11:00–12:30 - 🖥️ Operaciones en imagenes (Lorena Sigaut)
- Desde como abrir una imagen hasta las operaciones básicas en y con imágenes

13:30–14:10 - 🧠 Segmentación clásica y Cuantificación (Agustin Corbat)
- Teoría de segmentación clásica y cuantificación
14:10–14:40 - ☕ Coffee Break
14:40–16:30 - 🖥️ Segmentación y Cuantificación (Agustin Corbat)
- Sesión práctica de segmentación y cuantificación
16:30–17:00 - Cierre

9:00–10:30 - 🧠 Workflows reproducibles (Suganya Sivagurunathan)
- Principios de flujos de trabajo reproducibles
10:30–11:00 - ☕ Coffee Break
11:00–12:30 - 🖥️ Comparación de herramientas: Interfaces gráficas de usuario (GUI), macros y programación (Coding) (Agustin Corbat)
- Comparación de GUI, macros y programación de distinto software
12:30–13:00 - Organización de BYOW
- BYOW - Other Tools

14:00–16:30 - 🖥️ (incluye ☕) Taller de Git y Pixi (Mauro Silberberg)
- Control de versiones con Git y gestión de entornos con Pixi
16:30–17:00 - Cierre

09:00–10:00 - 🧠 Machine Learning (Federico Lecumberry)
- Fundamentos de Machine Learning para análisis de bioimágenes
- Machine Learning aplicado a segmentacion y a clasificacion de objetos
10:00–10:30 - ☕ Coffee Break
10:30–12:00 - 🖥️ Machine Learning (Federico Lecumberry)
- Aplicaciones de ML a segmentacion de bioimágenes

13:00–15:00 - 🧠 (incluye ☕) Deep Learning (Enzo Ferrante)
- Teoría y conceptos de Deep Learning
15:00–17:00 - 🗫🖥️ BYOW - Other Tools (Lorena Sigaut)
- Build your own workshop y aprender a explorar otras herramientas de bioimagen como tracking, colocalización, registro de imágenes, spectral unmixing, phasors, deconvolution, transcriptómica espacial…

09:00–10:00 - 🖥️ (incluye ☕) Taller de Deep Learning (Agustin Corbat)
- Taller práctico de Deep Learning
10:00–10:30 - ☕ Coffee Break
10:30–12:00 - 🖥️ Clasificación de objetos (Agustin Corbat)
- Clasificación de objetos, reducción de dimensionalidad y clustering

13:00–13:45 - 🧠 Deep Learning for BIA (Agustin Corbat)
- Modelos típicos usados en análisis de bioimágenes
13:45–14:00 - ☕ Coffee Break
14:00–15:30 - 🖥️ Taller de Cellpose, StarDist and friends (Ignacio Sallaberry y Agustin Corbat)
- Herramientas prácticas de segmentación DL: Cellpose, StarDist, BioModel Zoo, etc.
15:30–16:30 - 🗫🖥️ BYOW - Other Tools (Lorena Sigaut)
16:30–17:00 - Cierre

09:00–11:00 - 🧠 (incluye ☕) ¿Como hacer escuelas y cursos? (Martin Schätz)
- Diseño de cursos de capacitación y estrategias de enseñanza
11:00–13:00 - 🗫 Discusiones sobre AI y como usarla (Agustin Corbat)
- Discusión sobre el uso de AI en bioimágenes y diseño de clases

14:00–16:00 - 🗫 (incluye ☕) Discusiones sobre los tutoriales de BYOW y otras herramientas
- Puesta en común de las herramientas exploradas en la sesión de BYOW - Other Tools
16:00–17:00 - Cierre